2008年以来，安吉大熊猫馆和德清下渚湖湿地公园共引进6只大熊猫，为湖州开展大熊猫保护和科研工作奠定了基础。

    2008年，湖州启动朱鹮浙江种群重建项目，当年引进朱鹮5对。2009年11月和2011年12月，我国上世纪80年代赠送日本的朱鹮后代分两批共18只小朱鹮正式安家下渚湖朱鹮繁育基地。这一项目在浙江大学的技术支撑下，取得了实质性进展和阶段性成果。

    目前，基地朱鹮总数从原来的10只增长到146只。湖州正着手启动朱鹮野化训练基地建设，于2014年11月中旬对浙江朱鹮进行野外放归。

    长兴县尹家边扬子鳄保护区经过30多年的努力，扬子鳄数量从最初的11条，发展到了目前的3000多条。2012年4月15日，长兴县将140条“青壮年”扬子鳄回归自然。2013年5月-6月，长兴县再从核心种群中挑选了120条亚成体和成年鳄放归野外。放归自然的每条扬子鳄都植入了芯片，进行科学观察，同时避免近亲繁殖，确保种群品质。

    安吉小鲵是1992年发现的龙王山特有的珍稀两栖动物，由于分布范围狭窄，种群数量稀少，2000年被国家林业局列入国家“三有”动物名录，2004年被世界自然保护联盟（IUCN）列入世界十大极度濒危两栖动物之一。“十二五”期间，龙王山保护区将安吉小鲵种群及其栖息地的保护作为重点建设项目，先后进行了栖息地保护、湿地修复、人工孵化养殖等工作。保护区从2008年开始人工孵化养殖安吉小鲵幼苗，观察安吉小鲵的整个发育生长过程，探索安吉小鲵的濒危机制。2011年以来，成功放归成体500条。2013年至2014年，保护区管理处与沈阳师范大学两栖爬行动物研究所合作，成功向国家林业局申报安吉小鲵的专项调查，研究安吉小鲵的资源现状和种群动态，为有效保护、科学管理、可持续发展和合理利用安吉小鲵资源提供依据。

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